圖：南京大屠殺紀念館獲捐贈的一張侵華日軍化學戰照片/資料圖片
1945年，日本戰敗。榮字1644部隊的主要骨幹，在中國軍隊進入之前，都設法逃回了日本，只有1644部隊第四任部隊長佐藤俊二被前蘇軍捕獲。
1949年12月25日至30日，蘇聯濱海軍區軍事法庭在伯力城對戰爭時期日軍實施細菌實驗和細菌戰的罪行進行了公開審判，認定關東軍司令官山田乙三以及日軍731部隊幹員梢塚隆二、佐藤俊二等12人犯有製造細菌武器、人體實驗、實施細菌戰等罪行。
1949年12月6日，山田乙三在受審時承認：「在活人身上進行實驗一舉，原是我的一位前任梅津將軍或植田將軍批准的。在這點上，我承認我的罪過是，我明知道有對活人進行實驗的事實，卻准許人們去進行此種實驗，因而我在事實上也就是批准了強行殺害那些都是由我所管轄的關東憲兵機關和各日本軍事團送去受實驗的中國人，俄國人和滿洲本地人。」
佐藤俊二，在1941年至1943年間任波字8604部隊部隊長和榮字1644部隊長。
佐藤俊二作為被告受訊時供稱：「我在任榮字部隊長時……領導過本部隊內探求和大量生產細菌武器的工作。為了這個目的，南方榮字部隊裝置有大量器械，配備有各種細菌專家，因而能大規模培養致命細菌……訓練部在我領導下，每年培養出約300名細菌學家，以供進行細菌戰的需要。」
佐藤俊二還供認：南京榮字1644部隊在培養致命細菌方面的生產能力，每一生產周期內計達10公斤。
