莫樹錦重點研究與肺癌有關的生物標記和分子標靶治療及免疫治療，他的研究確立標靶治療為EGFR基因變異肺癌的一線治療方案，亦揭示標靶治療較傳統化療更有效治療ALK陽性肺癌的晚期肺癌患者，這種癌症患者的存活期一般可超過三至五年。
他的研究成果扭轉了肺癌治療的方向，訂定了全球肺癌治療的新準則。
莫樹錦表示，如今有約八種新藥出現，給肺癌患者帶來福音，此外，免疫療法和細胞療法也給肺癌患者帶來曙光。莫樹錦說，部分患者肺癌細胞表面上有PD-L1蛋白，如果驗出病人腫瘤的免疫球蛋白PD-L1比例超過50%，就可用免疫療法作第一線治療，此療法只需打針注射即可。他還強調，早期肺癌可以手術開刀治療，但到了晚期就於事無補了。
2018年10月，莫樹錦榮獲歐洲腫瘤學學會（European Society for Medical Oncology）所頒發的終身成就獎（Lifetime Achievement Award），以表揚他於肺癌領域研究對全球帶來重大貢獻。
