醫療有診斷和治療兩大方面，納米機械人既可用於診斷亦可用於治療，機械人可進入人體內的器官、細胞，甚至DNA等位置進行治療，包括把藥物放到細胞上，對細胞進行檢查，突破醫生做手術的大小、距離、環境等限制。
納米機械人進入人體後，人如何控制？去年香港大學研發「光控納米機械人」，利用光控制機械人的移動，但主流方案仍多以「磁控納米機械人」為主，改變磁場的方向和強度來控制機械人的動作，實現遠程操控。
