民進黨有史以來首次全面執政，黨內的權力鬥爭日趨激烈，尤其掌握龐大行政資源的「行政院長」林全並非民進黨人，更成為各派系的眾矢之的。「獨派」近月來已不斷放話，說「林全只適合當幕僚」、「林全拖累（民進黨當局領導人）蔡英文的聲勢」雲雲。與此同時，關於高雄市長陳菊北上接任「行政院長」的消息甚囂塵上。如履薄冰的林全似有下台的預感，聲稱「每天都當最後一天在做」。對於黨內「反林」勢力來勢洶洶，蔡英文展開「閣揆保衛戰」，與其說為了保住林全，其實是與黨內派系較勁。倘若行政大權落入某一派系手中，必打破現今的權力平衡，引發黨內新一輪權力傾軋。

　　林全可謂蔡英文的左右手，過去這些年曾擔任小英教育基金會執行長、民進黨智庫「新境界」執行長、蔡英文選舉政綱操盤手，早已是蔡英文心中「行政院長」的第一人選。而且林全在財經方面擁有完整的資歷，既是知名財經學者，又曾任財經技術官員，也在業界擔任過公司高層，可營造新政府「拚經濟」的形象。不過，蔡英文重用林全除了出於深厚的私人情誼及器重其才能，更為避免民進黨各派系掀起內鬥。當年陳水扁執政時大玩權力恐怖平衡遊戲，讓「四大天王」彼此牽制：呂秀蓮任「副總統」，游錫堃、蘇貞昌、謝長廷則輪流擔任「行政院長」，不讓某一派系獨大。如今蔡英文啟用黨外人士以壓制黨內內訌，也是同樣的目的。

　　然而，林全「內閣」出師不利，讓蔡英文尷尬不已：陸客人數不斷下降，政府手足無措，業者怨聲載道；全盤接受華航罷工者的要求，被批評「會吵的小孩有糖吃」；「一例一休」引發巨大爭議，勞工批評蔡英文政府違背選舉承諾；颱風過後兩星期，菜價居高不下，民眾叫苦連天。民調顯示，對林全「內閣」的不滿意度已經超過滿意度。這無疑給了「獨派」等派系拉林全下台的充分理由。此外，蔡英文本身也因不承認「九二共識」導致兩岸聯繫溝通機制停擺、兩岸關係陷入僵局而聲勢大跌，不得不向「獨派」取暖，牢固基本盤。最近蔡英文提名多名具有「獨派」色彩的人士出任「司法院長」及大法官，正是為了安撫「獨派」，同時也是化解「獨派」對林全的壓力。

　　「行政院長」是當局領導人的政策執政者，如果有「二心」，勢必使當局領導人的政策「令不出『總統府』」，這正是蔡英文最擔心的情況。所以，不管「獨派」如何軟硬兼施，她都力挺林全，就是要保住手中的權力不被派系瓜分，使自己不至於成為牽線木偶。