同時，南京各小學已經下發通知，要求各校四五六年級的學生及同住家人、四五六年級的教職員工及同住家人、以及復課後其他需要進入校園的學校教職員工及同住家人，於4月12日再次進行一次核酸檢測。在此之前，南京中小學生已經按要求進行近10次核酸檢測。
不過，其他學段年級返校復學安排尚未明確。南京市疫情防控應急指揮體系學校防控組表示，將根據該市疫情防控形勢，報經市疫情防控應急指揮體系批準後，提前向社會公布。
3月中旬南京市再次暴發新冠疫情後，京市新冠肺炎疫情聯防聯控工作指揮部即決定自3月16日起，全市中小學(含中等職業學校、特殊教育學校、外籍人員子女學校、技工學校等)暫停線下教學，各校組織開展線上教學，幼兒園暫停入園。同時，全市實施小區封閉管理，並提倡居家辦公、在線辦公。
