李明哲系首位被判處顛覆國家政權罪的台灣居民，11月28 日上午，大陸湖南省岳陽市中級人民法院依法一審公開宣判，認定李明哲犯顛覆國家政權罪，判處其有期徒刑五年，剝奪政治權利二年，李明哲當庭表示服從判決不上訴。
馬曉光在國台辦例行記者會上回應相關問題時指出，在李明哲案偵查審理過程中，大陸辦案機關嚴格按照法律規定和法定程序辦案，嚴格依據犯罪事實、性質、情節和對於社會的危害程度依法作出判決，充分保障被告人的合法權益。
他特別強調，任何企圖利用李明哲案進行政治炒作、挑撥兩岸同胞感情對立的做法都是徒勞的。
談及島內對李明哲案的一些聲音，馬曉光強調了三點，首先李明哲犯有顛覆國家政權罪，犯罪事實清楚、證據確鑿充分，有組織、有計劃、有行動，而台灣有些人無視事實，一味攻擊大陸，這才是對兩岸關係的嚴重傷害。李明哲所作所為是否危害大陸的安全與穩定，應該由大陸法律判定，而不是由台灣當局和一些政治組織的主觀偏見判定。
其次，馬曉光說，尊重彼此對發展道路和社會制度的選擇，這是兩岸之間發展關係的起碼底線。「我們尊重台灣現有的社會制度和台灣同胞的生活方式，但這並不意味着台灣方面可以把自己的政治理念強加給大陸，也不意味着台灣個別人打着『民主自由』的幌子，就可隨意觸犯大陸法律。」絕大多數台灣民眾會有這樣的「同理心」。
第三，馬曉光續說，由於歷史原因，兩岸選擇了不同的發展道路。台灣社會在民進黨當局執政下情況如何，相信台灣民眾自有切身的感受和判斷。而大陸在中國共產黨領導下，中國特色社會主義事業取得了舉世矚目的成就，政治、經濟、社會、文化、生態文明建設全面推進，人民生活水平大幅改善，國際地位和影響顯著提升，中華民族迎來了從站起來、富起來到強起來的偉大飛躍，比歷史上任何時期都更接近中華民族偉大復興的目標。
「事實已經證明，我們所走的中國特色社會主義道路最符合廣大人民的根本利益，得到人民群眾的衷心擁護，也使得越來越多的台灣同胞開始以客觀、理性的眼光來看待大陸。」馬曉光強調。
對於有台媒質疑，陪同李明哲太太李淨瑜到大陸聆聽判決的台前「立法委員」王麗萍在長沙機場以台胞證遭註銷為由被遣送回台。馬曉光表示，按照規定，台灣同胞持有效證件均可正常往來大陸，「個別人員無法入境的原因，應當自己心裡清楚。」他強調，李明哲家屬此行赴岳陽旁聽宣判，台灣方面是有隨行人員的。
