海關新購淺水巡邏艇於2016年五月投入服務，該巡邏艇於內地常州建造，每艘價值400萬元，航速可達每小時50海里，比舊船快11海里，除更新雷達系統、全球定位儀及電子海圖外，淺水巡邏艇更增設測深儀，提升追截高速走私快艇的能力，並有效地在淺水區域巡邏及支援潛水隊員的工作。
新淺水巡邏艇的特點之一是能在只有0.5米的淺水區內航行，海關目前有兩艘新淺水艇，能有效地迫使目標船隻於淺水區內擱淺。
