陳肇始指，疫苗通行證作為增加接種誘因，在合理情況下要求進入處所人士打針，讓社會能安全正常運行，是屬必要一環，在個人接種疫苗效益大於風險的前提下，政府以提高防疫屏障為目標是合理做法。陳肇始指現時12歲以上的第三針接種率僅約五成，在疫情稍緩和時絕不能鬆懈，須與時間競賽鞏固防疫屏障，現階段將個別疫苗效益並非最高的群組豁免疫苗通行證，有違措施原意，亦對已打針者不公，呼籲合資格市民盡快接種第三針。
港大微生物學系講座教授袁國勇、同系名譽助理教授龍振邦及臨牀助理教授薛達亦聯合撰文，指疫苗通行證能有效促進疫苗接種，如只限於長者，有違公平原則，又指因放寬社交距離措施後，或出現群組爆發屬預期內，未接種疫苗人士進入指定處所有風險。
文章又提到60歲以下但有慢性病者，如染疫，重症及死亡風險不會較70歲以上健康長者低，又指疫苗通行證如只限某個年齡層，場所負責人執行措施時亦有困難，重申不論老幼打針均對社會有益，當全民接種率達95%，便可取消疫苗通行證要求，但仍須戴口罩至明年春季，若在今年冬季流感高峰，沒有發現比Omicron變種病毒更強的病毒，便可研究放寬戴口罩。
