目前，跨境出租汽車許可證分有「酒店」、「旅遊」，以及「私家服務（豪華房車─過境）出租汽車」等類別，其中申請往來粵港兩地過境車輛許可證，因受特區政府與廣東省政府共同管理的配額制度規管，申請較繁複。
首先申請人需取得內地相關部門發出的營業執照及批准文件，並向當局申請配額；當兩地政府決定接受該配額申請後，運輸署會在港報章刊登廣告，說明邀請符合資格申請人向運輸署及廣東省人民政府口岸辦公室陸空口岸處遞交申請，再進行審批。審批完成後，申請人需另向香港運輸署申請「私家服務（豪華房車─過境）出租汽車」許可證，據知，所有出租汽車許可證申請均由出租汽車許可證遴選委員會考慮，一切獲得通過，始由運輸署署長批准有關申請。
