中國（深圳）綜合開發研究院港澳及區域發展研究所副主任研究員劉雪菲認為，河套數學院落地在河套深圳園區，極大便利了香港等地區的深度參與，「香港可圍繞『基礎科學引領交叉創新』理念，從基礎攻堅和複合人才培育兩方面深度參與。」
當前，河套數學院與香港中文大學已開展了深度合作：在丘成桐院士推動下，港中大成立了致真交叉數學科學院；港中大的學生未來也將進入內地開展研究。「香港的高校與科研機構都可以與河套數學院逐漸建立合作關係。」
劉雪菲認為，雙方首先可以共同承擔和發起大科學計劃。例如，以生物學或醫學為代表的傳統單一學科已無法應對現代科技和醫療的複雜挑戰，未來的突破性進展必然來自於多學科的深度交叉與融合。「深港合作之下，可以打破學科壁壘，將數學家、生物學家、工程師、醫生等聚集在一起，用共同的『工程語言』或『數學語言』解決複雜、攻克科學難題。」
另一方面則是人才共育上的合作。劉雪菲建議，依託香港高校的國際師資與研究院共建「雙聘教授」機制，譬如數學家與生物學家聯合指導之下，培養出能攻克等跨學科難題的複合型人才。
