本港沒有針對異端教派的法例，任何教派均可公開宣教，有團體認為，「全能神」反人倫的言行已證明是異端，惟部分基督教會面對該教派員滲透顯得方寸大亂，有牧師懷疑兩名傳道人被「全能神」洗腦，怒將二人開除，事後發覺錯怪兩人。

　　新興宗教關注事工總幹事楊子聰表示，「全能神」雖自稱信仰基督，但竟稱「信耶穌已不能得救，信『全能神』才能得救」，不少教義也脫離聖經，又規定不向樣貌醜陋、嚴重殘疾和頭腦愚蠢人士傳教，有違基督博愛精神，而且對教友操控性強，有明顯的異端特質。

　　楊稱數年前曾與「全能神」代表會面，對方稱，反對信奉「全能神」的人是邪靈，感覺該教「將人妖魔化」。他所接觸的個案可見，入教者因不獲家人支持，視至親為「惡人」，最終疏遠家人，甚至離家出走，相信背後有人煽動，有關做法無疑破壞家庭和違反人倫，屬於異端。

　　梵蒂岡籲信徒警惕

　　楊續稱，「全能神」會暗地派員加入傳統基督教會，私下邀約個別教友查經，從中「拉羊」，即改變對方信仰，令部分教會難以應對，有主任牧師更誠惶誠恐，以為教會大部分人被「洗腦」，其後開除兩名傳道人，導致謠言四起，大批教友離去，最後證實兩人是冤枉，惟事件已對教會造成嚴重傷害。

　　天主教也高度關注「全能神」滲透，梵蒂岡《信仰通訊社》早於2013年發稿，稱「全能神」以欺詐手段勒索天主教領袖，又製造醜聞，在福音派基督徒甚至天主教徒之間製造混亂，呼籲信徒警惕。