一九九○年代，臨時房屋區開始陸續清拆，為了繼續提供臨時居所予有需要市民，房委會便設置了中轉房屋。

　　中轉房屋為未符合入住正常公共屋邨資格的寮屋清拆戶，和受清拆、天災或其他原因影響的人士提供臨時居所，於一九九○年代中期起逐漸取代臨時房屋區角色。受影響人士會先被安排入住臨時收容中心，以等候審核是否合乎中轉房屋的資格，尤其適用於受清拆影響而居於私人住宅樓宇的居民。

　　由於興建永久建築物需時，以及需要安置臨時房屋區的居民，當局首先於一九九六年暫時把原本拆卸重建的石籬（二）邨第十座和第十一座、葵盛東邨第十二座改裝為中轉房屋，即石籬中轉房屋及葵盛中轉房屋。及後，當局於西貢和元朗找到兩塊臨時土地，於一九九八年興建第一批新建的組件中轉房屋，即西貢中轉房屋和朗邊中轉房屋，特點為樓層較少（樓高只有六層）及使用預製組件興建，目前已清拆。

　　為應付中轉房屋的需求，當局決定興建規模較大的新式多層中轉房屋，即是屯門的寶田中轉房屋（今寶田邨）及天水圍的天恩中轉房屋（今天恩邨一至四座），分別於二○○○年及二○○一年落成。與組件中轉房屋比較，多層中轉房屋樓層較多（樓高二十八層）及提供較多單位（每層單位三十六個，寶田邨第九座除外），外形亦由長形改為十字形。然而，與一般公屋比較，單位面積較細少，而且廁所較狹窄。

　　大多數因為僭建物清拆（早年寮屋除外，另有安置政策針對已登記寮屋戶）、天災等需要臨時安置的人士，都會先被安排入住臨時收容中心，以審核是否合乎中轉房屋的資格。

　　雖然中轉房屋設施較為殘舊，位置亦不在市區，但這是入住公共房屋的階梯之一，反正屬於過渡性房屋，入住的年期有限，因此人們也樂意接受這項上樓前的臨時安排。