劉慧卿過去在民主黨培植親信，一手捧紅被當成「契仔」的林卓廷，結果林卓廷在黨內打壓異己，令59人一同退黨，當中主要是新界東支部成員，成為民主黨近年最轟動的退黨事件。惟劉慧卿事後仍「死撐」林卓廷，對退黨人士冷嘲熱諷。另一方面，劉慧卿曾炮轟許智峯搶政府人員手機，但其領導的紀律委員會卻對事件不了了之，可謂「雷聲大雨點小」。

　　2008年，劉慧卿所屬的「前綫」與民主黨合併。2012年，劉慧卿擔任民主黨主席。2016年，劉慧卿準備退下一線，不再擔任立法會議員，但令人意外的是，她並未支持「前綫系」參選立法會，反而讓林卓廷接棒，令「前綫系」頓覺心灰意冷。

　　許智峯黨紀調查不了了之

　　2018年12月，59名民主黨成員集體退黨，眾人矛頭直指時任新界東立法會議員林卓廷，並發聲明譴責他在黨務問題上雙重標準、態度專橫、黨同伐異、以權謀私，狠批林卓廷「人格卑劣」、「毫無政治道德」。

　　有份退出的區鎮樺接受雜誌訪問時聲言，民主黨「大佬文化」變本加厲，林卓廷幾年前獲劉慧卿提拔執掌新東支部，就是經典例子，劉慧卿與林卓廷同一陣線，令「前綫系」成員萬念俱灰。劉慧卿當時回應退黨事件時，十分冷漠地稱「勉強冇幸福，如果唔開心就離開囉」。

　　此外，劉慧卿亦被外界批評「表面一套，背後一套」。2018年，前民主黨立法會議員許智峯在立法會搶走政府職員手機，被凍結黨籍。劉慧卿表面上怒斥許「非常之錯」、「唔知道佢點諗嘢」、「不適合留在議會和民主黨」。然而，黨內對事件展開所謂紀律聆訊的，正是由劉擔任主席的紀律委員會。結果許智峯的黨籍在2019年7月解凍，甚至獲准報名參加2019年區議會選舉。所謂黨內調查，不了了之。