11月中文大學被佔領期間，有暴徒大肆破壞通往中大的大學車站內設施，並分別向停放在大學站及上水站的列車車廂縱火，事後大學站須關閉維修，至今重開無期。港鐵形容，大學站由於遭受龐大的嚴重破壞，需要深層次復修，近乎要重建車站。
港鐵曾安排傳媒到遭暴徒破壞的大學站實地觀察，現場所見，站內大部分入閘機被砸毀，扯出的外露電線遭剪斷、組件受損。車站顯示屏、天花及月台車長室，以至客務中心等均被肆意破壞，留有遭縱火痕跡，瀰漫燒焦味。通往月台的扶手電梯等亦同遭暴劫。
