自2007年與九鐵合併後，港鐵接手管理落馬洲及錦田濕地，但有別於米埔自然保護區，落馬洲濕地鮮有開放公眾進入，每年僅三次安排團體參觀，公眾只可透過落馬洲站觀鳥區望遠鏡觀察。濕地為雀鳥棲息的天堂，豐富的生物多樣性極具研究價值，其中香港大學的專家學者亦會申請到濕地展開有關研究，例如歐亞水獺。
